Tijdens de bachelor werd ik geïnspireerd door colleges van docenten zoals Marc van Mill en Fried Zwartkruis, met name tijdens de vakken Genoom en Moleculaire Biologie van de Cel. In deze vakken leerde ik over het ontstaan van kankercellen en de effecten van tumoren op het lichaam. Dit wekte mijn interesse om me verder te verdiepen in dit onderwerp. Daarom koos ik voor mijn individueel project (IP) een stage in een lab dat onderzoek doet naar kanker.

Mijn stage vond plaats in het Laboratory of Translational Oncology in het UMC Utrecht, waar ik onder begeleiding van Lidwien Smabers aan twee verschillende experimenten mocht werken. Tijdens mijn stage heb ik veel gewerkt aan patient-derived colorectal cancer (CRC) organoids. Vooral in het begin vond ik het werken op een ML-I lab met organoids best ingewikkeld, omdat er veel dingen zijn waar je tegelijkertijd rekening mee moet houden. Denk aan het steriel werken, verschillende concentraties groeifactoren en alles nauwkeurig noteren in je labjournaal. Maar juist van deze uitdagingen heb ik uiteindelijk het meeste geleerd!

In het eerste experiment bepaalde ik de eiwitconcentratie van verschillende organoidlijnen, waarna deze opgestuurd konden worden voor phosphoproteomics analyse door het Cancer Centre in Amsterdam. Met phosphoproteomics kan de fosforylatiestatus van eiwitten in organoids van patiënten die nog niet behandeld waren voor CRC worden vergeleken met die van patiënten die wel behandeld waren, maar chemo-ongevoelig waren. Het proteoom is enorm nuttig om te onderzoeken omdat het meer inzicht kan verschaffen in wat chemo- ongevoeligheid in patiënten veroorzaakt.

In het tweede gedeelte onderzocht ik of CRC organoids sensitiever zijn voor een specifieke drug die aangrijpt op de specifieke genetische veranderingen van de organoids dan organoidlijnen die deze veranderingen niet hebben. Anders gezegd: kunnen we door middel van whole-genome sequencing genetische targets vinden die we kunnen gebruiken in de behandeling van CRC-patiënten? Dit experiment vond ik ontzettend interessant, vooral omdat ik het hele proces – van het kweken van organoids tot en met de data-analyse – helemaal zelf mocht uitvoeren. Mijn stage heb ik daarom als een geweldige tijd ervaren waar ik enorm veel heb geleerd!

Hieronder zie je twee foto’s die ik heb gemaakt van de organoids waarmee ik gewerkt heb 🙂

(Links: 40x vergroot; Rechts: 100x vergroot)