Individueel project Jan Tekkelenburg
Mijn individueel project bestond uit twee delen. In het eerste gedeelte heb ik stage mogen lopen bij de groep van dr. Hugo van Ingen. Tijdens deze stage heb ik gekeken naar een eiwit genaamd Sox2. Sox2 is een belangrijk eiwit in verschillende biologische processen en is ook één van de Yamanaka factoren. Tijdens mijn stage mocht ik dit eiwit op moleculair niveau bestuderen met behulp van een fantastische techniek, namelijk met de nuclear magnetic resonance, in kort NMR. Het grote voordeel aan deze techniek is dat eiwitten niet gedenatureerd hoeven te worden en daarom is het mogelijk om interacties en conformatieveranderingen van een eiwit te bestuderen. Dit heb ik dan ook gedaan tijdens mijn stage. Ik heb namelijk gekeken naar welk gedeelte van het Sox2 eiwit belangrijk is bij de interactie tussen Sox2 en DNA.
Na mijn stage ben ik begonnen aan het tweede gedeelte van mijn project, namelijk het maken van een animatievideo over mijn stage. Dit heb ik gedaan met de software van het programma Blender. In dit programma kan je een virtuele 3D omgeving maken en binnen deze omgeving is het mogelijk om een camera te laten bewegen om zo een animatie te maken. Dit programma heeft ontzettend veel mogelijkheden denk bijvoorbeeld aan het modeleren van eiwitten en DNA of het simuleren van bijvoorbeeld zwaartekracht op een voorwerp. Dit maakt het een ontzettend mooi programma om animaties mee te maken, maar ook enorm ingewikkeld. Zeker de eerste weken heb ik heel veel tijd gestoken in het leren van de basisvaardigheden. Toen ik deze basis eenmaal onder de knie had ging het animeren een stuk beter al waren dingen als het simuleren van een vloeistof met zwaartekracht een enorme uitdaging.
Sommige onderdelen van de video zijn nog vertrouwelijk en het is daarom niet mogelijk om de gehele video online te zetten. Hier zijn echter enkele sfeerbeelden uit de video om een kleine impressie te geven.